Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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