Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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