Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms