Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms