Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ODF3BA8MYP8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms