Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms