Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD83Q01151 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms