Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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