Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms