Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms