Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms