Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP164Q9UPV0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms