Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.2 ms