Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms