Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC27Q2M243 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms