Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms