Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms