Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIG1P18858 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIG1P18858 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms