Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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