Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms