Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ZNF506-203ENST00000540806 1424 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 HULC-201ENST00000503668 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 HDAC2-AS2-211ENST00000520034 790 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC079385.2-201ENST00000547531 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 Z95114.2-201ENST00000623490 2205 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01559Q495D7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms