Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms