Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms