Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLK1P49759 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLK1P49759 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLK1P49759 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLK1P49759 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLK1P49759 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLK1P49759 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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