Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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