Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms