Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC44.03■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.97■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
DCAF1Q9Y4B6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
DCAF1Q9Y4B6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC43.88■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC43.86■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms