Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAD54L2Q9Y4B4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms