Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPB41L3Q9Y2J2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms