Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MED23Q9ULK4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms