Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms