Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB4Q9UDY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms