Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD3Q9NYL9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD3Q9NYL9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms