Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FANCLQ9NW38 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCLQ9NW38 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms