Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms