Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGRNQ9NPE2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGRNQ9NPE2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NGRNQ9NPE2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms