Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLMPQ9H6B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLMPQ9H6B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms