Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SENP3Q9H4L4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SENP3Q9H4L4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms