Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRRTQ9BXP5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms