Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRIP1Q9BX63 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms