Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED1Q99966 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms