Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN18Q99952 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms