Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ARXQ96QS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms