Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms