Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms