Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC10A4Q96EP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms