Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VWCEQ96DN2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms