Protein–RNA interactions for Protein: Q96AP4

ZUFSP, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZUFSPQ96AP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZUFSPQ96AP4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZUFSPQ96AP4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms