Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms