Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1MTQ969P6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms